Nuage COVID
Réunissant l'expertise canadienne pour fournir une surveillance en temps réel du virus COVID-19.
Résumé du projet
Mis à jour le 31 mars 2023.
Le problème
Alors que le COVID-19 continue de se propager à l'échelle mondiale, il est urgent de comprendre l'empreinte ADN de ce virus en évolution rapide.
Comment nous le résolvons
Dirigé par DNAstack, le projet COVID Cloud exploite les capacités de recherche en génomique du Canada pour séquencer, partager et analyser rapidement le profil génomique de la COVID-19 et des personnes qui l'ont contractée au Canada et dans le monde. Ces informations contribueront à éclairer l'élaboration de politiques de santé publique, de diagnostics, de thérapies et de vaccins. De nombreux pays, dont le Canada, mobilisent leurs efforts pour générer de gros volumes de données sur les séquences génomiques. Cependant, des défis importants subsistent dans l'utilisation de la technologie pour exploiter les données et l'utilisation des informations pour fournir des informations en temps opportun.
COVID Cloud rassemble l'expertise canadienne dans des domaines tels que la science du génome, les maladies infectieuses, la virologie, le génie logiciel, l'intelligence artificielle, l'informatique en nuage, les produits pharmaceutiques et les politiques pour accélérer le développement d'une plateforme technologique numérique permettant de surveiller le virus en temps quasi réel. souches évolutives, schémas de transmission, taux de mutation et cibles médicamenteuses.
En plus d'accélérer la réponse au COVID-19, la plateforme servira de tremplin pour tirer davantage parti de la génomique et de la santé de précision dans les années à venir, notamment en se préparant aux futures vagues et épidémies d'autres maladies infectieuses.
Le Résultat
Ce projet a livré la plateforme COVID Cloud, rebaptisée par DNAstack comme IA virale, qui permet le partage de données en utilisant les normes de l'industrie et fournit aux scientifiques et aux décideurs de meilleures informations sur le COVID-19 dérivées de données génomiques, cliniques, épidémiologiques et autres en temps réel. Le développement technique de la plateforme COVID Cloud se poursuit alors que des partenariats ont été établis avec le ministère de la Santé de l'Ontario et Ontario Genomics pour déployer COVID Cloud comme solution pour soutenir la surveillance provinciale de la COVID et l'efficacité des mesures de santé publique. La plateforme COVID Cloud a été sélectionnée par le RCanGéCO pour fournir, aux côtés d’autres groupes, une plateforme nationale de partage de données qui permettra la surveillance des variantes à l’échelle nationale.
En 2021, Génome Canada a lancé le portail de données canadien VirusSeq. La technologie développée dans le cadre du projet COVID Cloud a été intégrée au portail, qui continue de jouer un rôle important dans la capacité du Canada à gérer les pandémies actuelles et futures. Ce projet a également soutenu le développement et la distribution du système Overture de l'OICR pour la gestion des données génomiques à grande échelle et du système Dockstore pour la gestion des flux de travail scientifiques. Les deux systèmes sont maintenant utilisés sur plusieurs sites au Canada et à l'étranger.
Chef de projet
Partenaires du projet
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« Chez DNAstack, nous avons l'objectif audacieux d'accélérer la recherche et la découverte biomédicales avec notre logiciel. Le Supercluster nous a fourni un cadre pour incuber et développer des produits logiciels aux côtés de partenaires qui croient aux mêmes principes et au même avenir que nous. Le projet COVID Cloud a créé une fondation pour continuer à développer ces partenariats et à soutenir l'innovation canadienne. Cette opportunité a donné lieu à un certain nombre de projets de suivi et non liés avec des partenaires récurrents, et notre solution de niveau entreprise est utilisée pour soutenir la prise de décision basée sur les données à l'échelle régionale, nationale et internationale. »
Co-fondateur et PDG, DNAstack Regardez la vidéo du projet COVID Cloud